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FISH等技术菌群鉴定服务

细菌是一类肉眼无法观察到的单细胞微生物,逐渐形成系统的分类学。1683年,荷兰科学家虎克发明了显微镜,并最先观察到细菌。根据细菌形态,将细菌分为球菌、杆菌和螺旋菌三大类。1884年,发明了一种新的染色方法,并根据细菌染色的着色情况分为革兰阳性菌和革兰阴性菌两大类。培养基的发明进一步为细菌的表型分类研究奠定了基础。细菌的一些基本生化特征,对氧气需求、氧化酶试验、触酶试验、糖发酵试验等,是细菌分类的重要依据。为了规范细菌的分类。美国医生伯杰意识到细菌统一命名的重要意义,1923年出版了《伯杰细菌学鉴定手册》,为统一的细菌鉴定、检索与分类提供了框架。1976年,美国科学家Woese建立了核糖体RNA编目法,为生物亲缘关系研究,特别是细菌的进化和分类研究奠定基础。尽管核糖体RNA基因编目法为主要依据的遗传学分类法,能反映菌种之间的亲缘关系,但在细菌的自然演化过程,不同的菌门、菌纲、菌目、菌科、菌属,甚至菌种之间,均不存在一个明显的基因分类的界线,因此,细菌的遗传学分类仍然不能抛弃传统的形态学、生理生化和化学特征。

FISH菌群鉴定的介绍

在原核微生物中16S rDNA序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的标准。16SrDNA序列基因约1500 bp左右,包括可变区和保守区,其保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异。16S rDNA鉴定包括测序,通过高通量测序和生物信息分析,检测群落多少,表达。无需分离培养细菌,实验操作简单。

然而有些时候,需要对菌群中某一种细菌再确认,需要FISHPCR检测。这种菌群鉴定到细菌种水平,具有重要诊断或治疗价值。如医学研究将菌群鉴定到种的级别,具有重要的临床给药治疗价值,诊断是否感染,选择抗生素,是否传染。在农业和生态环境生产中,海洋微生物、牲畜、水污染,农作物的生长既离不开与菌群的共生作用,也需要鉴定出占主导地位的菌种,缩小致病菌范,采取控制策略和方案。

    鉴定菌群方法:有原位杂交,PCR测序,宏基因组测序,16S rDNA PCR方法。对于我们。无论何种检测方法,收费均是:1200/样品。请参考外显子实验室网站www.focofish.com

荧光原位杂交(FISH)检测细菌的优势

1.快,2-4小时;

2.自由选择:多达2000个种,库存或优化设计的探针;

3.直观呈现阳性信号;

4.可以多色多种细菌的检测。





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