流式细胞术检测真菌的方法学实践
流式细胞术应用广泛,外显子生物利用流式细胞术与FISH技术结合,对培养的细菌、血液微生物,血液培养、痰液、肺泡灌洗液、污染的食品痰进行核酸探针液体杂交,然后行流式分析,发现探针杂交后细菌能很好地应用于流式分析和分选出目的细菌,可以在感染血液、痰液等上述样品中快速检测和识别感染的种水平的微生物。
与常规实验室方法PCR、测序、培养等技术。流式-FISH结合的方法,快速检测特定的细菌,初步试验还表明不仅可以检测细菌,还可以检测真菌属种,柯检测常见感染10多种微生物,如肺炎克雷伯氏菌属肺炎克雷伯菌,链球菌、金黄色葡萄球菌,致病大肠杆菌等等,本文我们针对开发一些真菌,如白色念珠、平滑、近平滑等等真菌进行简述,此外,寄生虫原位杂交将在后续实验中继续开发。
流式细胞术的标本如何处理呢?流式细胞技术应用于原位杂交,对标本处理要求不同,不需要用福尔马林固定,标本经过酒精等有机溶剂适当处理,适合用于快速鉴别在各种肺部感染、败血症患者、肠道感染微生物检测,能达到属或种的水平检测。
真菌在临床上比较常见,其检测面临一定难度,有些培养困难,时间久,培养难等问题,PCR和测序技术鉴别时间长、扩增特异性也存在一定难度。我们实验室应用特异性荧光原位杂交探针,与经过处理的真菌进行杂交。能够快速检测真菌的存在,我们利用常见的四种真菌为研究对象阳性对照,同时利用临床样本为未知检测额对象。其结果显示,真菌可以被液体原位杂交所检测。
本实验所开发的流式检测念珠球菌常见类型,念珠球菌已发现有270余种,其中引起人类致病的念珠菌主要有白色念珠菌(C.albicans)、热带念珠菌(C.tropical)、假热带念珠菌(C.pseudotropicalis)、近平滑念珠菌(C.parapsilosis)、克柔念珠菌(C.kruseii)、星形念珠菌(C.stellatoidea)、光滑念珠菌(C.glabrata)、高里念珠菌(C.guilliermondii),均为条件致病菌,其中以白色念珠菌毒力最强,最常见。念珠菌在普通培养基上生长较快,为椭圆形芽生细胞,在特殊培养基上形成菌丝。菌种的鉴别需依靠生化试验。
(一) 材料和方法
本实验流式细胞仪采用的孚流赛斯生物公司,检测标本为:血液、痰液、分泌物、棉拭子等液体体液标本。来源于临床样本,进行了灭活处理。采用的原位杂交探针、设计、标记、标本处理试剂盒、优化实验步骤均来源于外显子实验室。
(二)流式细胞检测细菌实验步骤
(1) 血清、污水、呕吐物、牛奶,腹腔积液等,适当的处理,8000rpm,离心1分钟;
本研究用的是真菌四种培养液,里面独立包含四种真菌,我们仅仅需要用溶菌酶处理30分钟;然后吸取20μl,开展后续实验。
(2) 混合培养液,吸取真菌培养液或其他含有真菌或细菌的上清20μL,加入细菌酶或真菌酶,0.5-1小时后,将配置好的核酸探针,85℃加热样品5分钟,60℃孵育0.5-2小时;
(3) 不必洗涤,吸取一定量杂交溶液,进行等5倍比例稀释,进行流式细胞仪上机检测,流式务必做好对照。包括只含空白探针对照、单纯待检测样品对照、待检测样品对照。
(4) 结果分析,设门的时候需要考虑颗粒大小,细胞一般20-50μM,细菌要小一些,真菌要大一些来参考,参考阴性对照,阳性荧光变化参考对照。
(三)流式细胞检测真菌的结果分析
1.热带白色念珠球菌的检出率约28%,描述(略)。
2.光滑白色念珠球菌的检出率约36%,描述(略)。
3.白色念珠球菌的检出率约64%,描述(略)。
(四)讨论
略
外显子生物专业提供各种荧光原位杂交探针试剂盒多年,核酸探针涵盖DNA、mRNA、miRNA、cicrRNA、LncRNA、nascent RNA、piRNA、细菌、真菌、寄生虫等原位杂交探针以及配套试剂盒和配套原位杂交检测设备,优化实验条件。熟练、快速、精准的应用各种核酸探针标记方法,并开发一些新的标记方法。
如果遇到更多问题,请联系我们。我们提供探针、试剂盒、耗材、设备等等。
联系电话:020-89895006 180 1199 7127 E mail:focobio@126.com
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