凝胶迁移试剂盒(EMSA Kit)
货号:R5130 规格:50T
本试剂盒室温运输,4℃储存。
试剂盒介绍:
电泳迁移率迁移分析,简称为“凝胶迁移”“EMSA”,生物素标记的DNA片段将含有特定DNA位点与DNA结合蛋白一起孵育。蛋白质DNA 通过非变性电泳将复合物与游离DNA分离,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳。蛋白质阻碍了结合的DNA片段的迁移。从而导致游离的DNA比DNA-蛋白质复合物迁移更快。凝胶结果揭示游离和结合的生物素标记DNA的位置。
试剂盒成份:
1、Bovine serum albumin (BSA; 50μg/μL,5%)
2、Buffer A
3、DNA loading buffer(bromophenol blue)
5、DTT; 0.1 M
6、0.5× TBE and 1% glycerol
7、Glycerol (20% v/v)
8、MgCl2 (0.1 M)
9、Poly(dI-dC) (1 μg/μL)
10、TBE buffer (5×)
自行准备如下试剂:
1、 TEMED
2、 Gel-fixing solution (20% methanol and 10% acetic acid)
3、 Acrylamide mix (30%;acrylamide:bisacrylamide, 29:1)
4、 Ammonium persulfate (10%)
5、 Binding protein (0.5–100 ng/μL)
6、 亲和素-HRP
简略步骤
1. 准备40 mL的4.5%丙烯酰胺凝胶。
丙烯酰胺混合物6.0 ml;
TBE缓冲液(5×)4 mL;
甘油(20%)2ml;
H2O 28ml;
过硫酸铵(10%)300μL。
2. 在倒入之前,添加30μL TEMED,摇动均匀。
3. 倒入凝胶。
4. 在10 mA下将凝胶预电泳2小时。
5. 在0.5 mL微量离心管中加入:
*EMSA结合Buffer20μL;(可直接购EMSA 5X buffer)
1)重组蛋白(0.5–100 ng /μL)2.00μL;
2)生物素标记的DNA(1 fmol /μL)2.00μL;
3)聚dI-dC(1μg/μL)0.40μL;
4)牛血清白蛋白(50μg/μL)0.50μL;
5)DTT(0.1 M)0.20μL;
6)氯化镁(0.1 M)1.50μL
7)缓冲液D 13.40μL
备注:上述样品可以等体积扩大。
6. 将样品在30°C下孵育1小时或在室温2小时。
7. 非常小心地将样品直接加样(即不添加染料)到样品池孔的底部。10mA条件,启动电源4.5%天然聚丙烯酰胺凝胶。加入少量(例如5μL)的DNA上样缓冲液。
8. 溴酚蓝大约在凝胶的三分之二处迁移。通常运行4-6小时就足够了,取决于DNA片段的大小。
9. 凝胶电泳完成后,小心除去缓冲液。取出凝胶。拆下垫片并分离板,保持凝胶附着在一块板上。
10. 将凝胶浸泡在亲和素-HRP溶液(1:500稀释)中,可用塑料袋。在凝胶固定溶液中固定15分钟。
11. 将凝胶放在两张吸水纸上。用保鲜膜覆盖凝胶的顶部,在凝胶干燥器上于70°C放置1小时。
12. 将干燥的凝胶暴露在HRP显影液中,曝光显影。
原因排除
问题:没有绑定条带。
解决:通常表明该蛋白质未浓缩或未结合该位点,或缓冲液条件与电泳过程中的蛋白质结合不兼容。尝试更大蛋白质浓度,改变缓冲液pH和盐浓度,替代电泳运行缓冲液,或在较冷的房间中于4°C运行凝胶。
问题:条带过多。
解决:额外的条带通常是由非特异性结合引起的。尝试添加更少的蛋白质而更多DNA探针。
问题:凝胶不干净。
解决:表明电泳过程中蛋白质解离,而电泳中蛋白质过多。反应或在太高的温度下电泳凝胶。电泳更多的凝胶慢慢地,降低蛋白质浓度,尝试在冷室中运行凝胶,改变缓冲液条件,或添加更多竞争者DNA。
EMSA相关试剂:
EMSA/Gel-Shift 结合5XBuffer
货号:R5130-1
储存:-20℃
体积:300μl
EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X) buffer 成份
10×binding buffer
Poly(dI.dC)
鱼鲑精DNA
50% 甘油
100uM MgCl2
10% NP-40
使用步骤:
见本公司EMSA试剂盒说明书,同其他厂家试剂盒通用。
EMSA loading buffer (10X)
货号:R5130-2
储存:-20℃
体积:1 ml
EMSA Loading buffer 成份,
Ficol 400等
未添加苯青和溴酚蓝指示剂
使用步骤:
见本公司EMSA试剂盒说明书,同其他厂家试剂盒通用。
EMSA loading buffer (10X,含染料)
货号:R5130-3
储存:-20℃
体积:1 ml
EMSA Loading buffer 成份,
Ficol 400等
添加苯青和溴酚蓝指示剂
使用步骤:
见本公司EMSA试剂盒说明书,同其他厂家试剂盒通用。
Poly(dI-dC) (1 μg/μL)
货号:R5130-4
储存:-20℃
体积:100μl
EMSA 生物素结合探针(订制)
货号:R5130-X
储存:-20℃
体积:500μl
TBE buffer 5X
货号:R5130-5
储存:-24℃
体积:100ml
50% 甘油 灭菌
货号:R5130-6
储存:-24℃
体积:10ml
EMSA探针见本网站相关网页。
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