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凝胶迁移试剂盒操作说明书 (EMSA)
作者:Exonlab 发布于:2022/8/18 16:54:02 点击量:

凝胶迁移试剂盒(EMSA Kit

货号:R5130                               规格:50T

本试剂盒室温运输,4℃储存。

 

试剂盒介绍:

电泳迁移率迁移分析,简称为“凝胶迁移”“EMSA”,生物素标记的DNA片段将含有特定DNA位点与DNA结合蛋白一起孵育。蛋白质DNA 通过非变性电泳将复合物与游离DNA分离,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳。蛋白质阻碍了结合的DNA片段的迁移。从而导致游离的DNADNA-蛋白质复合物迁移更快。凝胶结果揭示游离和结合的生物素标记DNA的位置

试剂盒成份:

1Bovine serum albumin (BSA; 50μg/μL,5%)

2Buffer A

3DNA loading bufferbromophenol blue

5DTT; 0.1 M

60.5× TBE and 1% glycerol

7Glycerol (20% v/v)

8MgCl2 (0.1 M)

9Poly(dI-dC) (1 μg/μL)

10TBE buffer (5×)

自行准备如下试剂:

1、  TEMED

2、  Gel-fixing solution (20% methanol and 10% acetic acid)

3、  Acrylamide mix (30%;acrylamide:bisacrylamide, 29:1)

4、  Ammonium persulfate (10%)

5、  Binding protein (0.5100 ng/μL)

6、  亲和素-HRP

简略步骤

1.    准备40 mL4.5%丙烯酰胺凝胶。

丙烯酰胺混合物6.0 ml

TBE缓冲液(5×)4 mL

甘油(20%)2ml

H2O 28ml

过硫酸铵(10%)300μL

2.    在倒入之前,添加30μL TEMED,摇动均匀。

3.    倒入凝胶。

4.    10 mA下将凝胶预电泳2小时。

5.    0.5 mL微量离心管中加入:

*EMSA结合Buffer20μL;(可直接购EMSA 5X buffer

1)重组蛋白(0.5100 ng /μL2.00μL

2)生物素标记的DNA1 fmol /μL2.00μL

3)聚dI-dC1μg/μL0.40μL

4)牛血清白蛋白(50μg/μL0.50μL

5DTT0.1 M0.20μL

6)氯化镁(0.1 M1.50μL

7)缓冲液D  13.40μL

     备注:上述样品可以等体积扩大。

6.    将样品在30°C下孵育1小时或在室温2小时。

7.    非常小心地将样品直接加样(即不添加染料)到样品池孔的底部。10mA条件,启动电源4.5%天然聚丙烯酰胺凝胶。加入少量(例如5μL)的DNA上样缓冲液。

8.    溴酚蓝大约在凝胶的三分之二处迁移。通常运行4-6小时就足够了,取决于DNA片段的大小。

9.    凝胶电泳完成后,小心除去缓冲液。取出凝胶。拆下垫片并分离板,保持凝胶附着在一块板上。

10.  将凝胶浸泡在亲和素-HRP溶液(1:500稀释)中,可用塑料袋。在凝胶固定溶液中固定15分钟。

11.  将凝胶放在两张吸水纸上。用保鲜膜覆盖凝胶的顶部,在凝胶干燥器上于70°C放置1小时。

12.  将干燥的凝胶暴露在HRP显影液中,曝光显影。

 

原因排除

问题:没有绑定条带。

解决:通常表明该蛋白质未浓缩或未结合该位点,或缓冲液条件与电泳过程中的蛋白质结合不兼容。尝试更大蛋白质浓度,改变缓冲液pH和盐浓度,替代电泳运行缓冲液,或在较冷的房间中于4°C运行凝胶。

问题:条带过多。

解决:额外的条带通常是由非特异性结合引起的。尝试添加更少的蛋白质而更多DNA探针。

问题:凝胶不干净。

解决:表明电泳过程中蛋白质解离,而电泳中蛋白质过多。反应或在太高的温度下电泳凝胶。电泳更多的凝胶慢慢地,降低蛋白质浓度,尝试在冷室中运行凝胶,改变缓冲液条件,或添加更多竞争者DNA

     

EMSA相关试剂:

EMSA/Gel-Shift 结合5XBuffer

货号:R5130-1

储存:-20

体积:300μl

EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X) buffer 成份

10×binding buffer  

Poly(dI.dC)

鱼鲑精DNA   

50% 甘油   

100uM MgCl2 

10% NP-40 

使用步骤:

见本公司EMSA试剂盒说明书,同其他厂家试剂盒通用。

 

EMSA loading buffer (10X)

货号:R5130-2

储存:-20

体积:1 ml

EMSA Loading buffer 成份,

Ficol 400

未添加苯青和溴酚蓝指示剂

使用步骤:

见本公司EMSA试剂盒说明书,同其他厂家试剂盒通用。

 

EMSA loading buffer (10X,含染料)

货号:R5130-3

储存:-20

体积:1 ml

EMSA Loading buffer 成份,

Ficol 400

添加苯青和溴酚蓝指示剂

使用步骤:

见本公司EMSA试剂盒说明书,同其他厂家试剂盒通用。

 

Poly(dI-dC) (1 μg/μL)

货号:R5130-4

储存:-20

体积:100μl

 

EMSA 生物素结合探针(订制)

货号:R5130-X

储存:-20

体积:500μl

 

TBE buffer 5X

货号:R5130-5

储存:-24

体积:100ml

 

50% 甘油 灭菌

货号:R5130-6

储存:-24

体积:10ml


EMSA探针见本网站相关网页。 




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