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mRNA FISH 实验案例(12)-Xist 原位杂交与免疫荧光共定位
作者:Exonlab 发布于:2022/9/28 18:58:30 点击量:

1. Xist探针准备

1)在 Xist 序列获得寡核苷酸探针(20-40 核苷酸长度的寡核苷酸,Tm=63-65ºC,标记多个地高辛或荧光素),探针最终浓度约为12-25μM。亦可联系我们制备和购买探针,赠送内参。

2)用杂交液将荧光或地高辛标记的探针稀释至终浓度为 250 nM 。杂交液配制:10%去离子甲酰胺,300mM NaCl30mM柠檬酸钠;1mg/ml牛血清白蛋白;10% DSS。亦可联系我们购买。

2.制备石蜡组织切片或培养细胞:

石蜡组织切片:详见石蜡组织切片mRNA原位杂交,类似于普通免疫组化切片。培养细胞:移去 6 孔培养皿中培养基。用 PBS清洗,吸出,在培养皿中加入 0.5ml 胰蛋白酶,孵育5-10分钟。加入5 ml 培养基,打数分散细胞。将细胞转移到 10ml 管中,在室温下以 1500 rpm 离心5 分钟。弃去培养基,悬浮细胞于1-2 ml PBS中,细胞备用,福尔马林或无水乙醇固定10分钟。用细胞对切片进行涂片或用设备甩片,37℃晾干,过夜。

3. 免疫荧光

1)将载玻片放入装有 PBSTT1x PBS 0.1% Tween-200.1% Triton-100)的染色盒或染色缸内中10分钟。(2) 将载玻片倾斜放置,移去液体,滴加100 μl 封闭溶液(1x PBS1% BSA0.1% Tween-20),覆盖玻片,在室温下孵育 10 分钟。(3)取下盖玻片,倒去封闭液,加入 40-100μl 稀释抗体(浓度为 1:500, 荧光抗体),注意避光。盖好盖玻片,室温避光孵育30分钟。

3. 原位杂交

1)将载玻片倾斜,抗体缓冲液顺玻片流下。在载玻片上加入 500 μl FISH 洗涤缓冲液(2x SSC+10% 甲酰胺),室温孵育5分钟。

2)倾斜玻片,去除 FISH 洗涤液,载玻片上加入20μl 寡核苷酸探针,盖上盖玻片,然后将载玻片转移到预热的湿盒内;在37°C孵育 2-24 小时。

3)玻片盒内加入 FISH 洗涤液,将洗涤液预热(如37°C水浴),FISH 洗涤缓冲液。载玻片孵育5分钟,期间,盖玻片从载玻片上脱落。

4)更换洗涤液,将载玻片洗涤缓冲液中继续孵育 5 分钟。

5)将载玻片滴加 0.5 ng/ml 含抗淬灭剂DAPI溶液(我公司有售)。

6)用指甲油或甘油封片,荧光显微镜下观察、拍照。4°C避光中保存几个月。




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