细菌原位杂交介绍之三-----不同标本类型的检测
1.培养后的细菌原位杂交:
(1) 细菌FISH探针的浓度为25-60μg/ml,即大约5-25μM浓度,杂交液稀释20-50倍。
(2) 将菌株震荡混合10秒,用钻石笔在玻璃上画圈,利用移液枪滴加50μL的细菌,并将载玻片置于37℃或室温干燥后1-24小时。
(3) 利用梯度乙醇浓度(50%,85%和95%)脱水,每次3分钟。在100%乙醇中脱水后,将载玻片风干,约1-60分钟。
(4) 杂交液稀释细菌探针(1:50)。取50μL探针溶液加在玻片上,加玻片,多出溶液用纸巾擦拭。放入孵育盒,然后盖好密封盖,避光48°C中杂交5小时或37℃过夜。
(5) 配置洗涤缓冲液(700mM NaCl 72 mL, 17mM Tris/HCl,0.1% SDS),在46°C或37℃的水浴中浸泡30分钟。
(6) 再利用纯水浸泡10分钟,去除多余的盐分。每片加50μL 抗荧光淬灭剂DAPI,室温避光静置20分钟。荧光显微镜下,观察结果,拍照。
2.新鲜组织的细菌原位杂交:
(1) 取材新鲜活体组织,使用卡氏固定液,固定3-12小时。石蜡包埋,切片5-8μM。
(2) 二甲苯中浸泡2次,10分钟每次,在梯度乙醇50%,80%和95%中,按顺序脱水,每次3分钟,晾干标本,约1-2小时。
(3) 将杂交液与探针按照25:1稀释细菌探针。取50μL探针溶液加在玻片上,加玻片,纸巾擦拭干净。放入保湿孵育盒,封盖,避光48°C中杂交5小时,或37℃过夜。
备注:如果是陈旧标本需要使用细菌原位杂交试剂进行处理,如需要,请联系我们。
(4) 洗涤缓冲液(700mM NaCl 72 mL, 17mM Tris/HCl,0.1% SDS),在46°C或37℃的水浴中浸泡30分钟。
(5) 再利用纯水浸泡10分钟,去除多余的盐分。每片加50μL 抗荧光淬灭剂DAPI,室温避光静置20分钟。观察结果。
(6) 在40倍或60倍或100倍荧光显微镜下观察,拍照。
3.血清和呕吐物的细菌原位杂交:
(7) 细菌FISH探针的浓度为25-60μg/ml,即大约5-25μM浓度,杂交液稀释20-50倍。
(8) 将血清或呕吐物,混合10秒,12000rpm,离心1分钟,用钻石笔在玻璃上画圈,利用移液枪滴加20-50μL的细菌,将载玻片置于56℃30min,或室温干燥1-24小时。
(9) 滴加梯度乙醇浓度(50%,85%和95%)脱水,每次1分钟。将载玻片风干,约20分钟。
(10) 杂交液稀释细菌探针(1:50)。取50μL探针滴液加到玻片,盖玻片覆盖,多出溶液用纸巾擦拭。放入孵育盒,然后盖好密封盖,避光56°C中杂交2小时或37℃过夜。
(11) 配置洗涤缓冲液(700mM NaCl 72 mL, 17mM Tris/HCl,0.1% SDS),在46°C或37℃的水浴中浸泡10-30分钟。
(12) 再利用纯水浸泡10分钟,用手甩干。每片加50μL 抗荧光淬灭剂DAPI,室温避光静置20分钟。荧光显微镜下,观察结果,拍照。
4.流式细胞与核酸杂交技术结合----细菌检测
外显子生物专业提供荧光原位杂交探针多年,探针涵盖DNA、mRNA、miRNA、cicrRNA、LncRNA、nascent RNA、piRNA、细菌、真菌、寄生虫等原位杂交探针以及配套试剂盒和配套原位杂交检测设备。熟练应用各种核酸探针标记方法。
流式细胞术应用广泛,我们利用流式细胞术与FISH技术结合,对培养的细菌、血液微生物,血液培养、痰液、肺泡灌洗液、污染的食品痰进行探针杂交,然后进行流式分析,发现探针杂交后细菌能很好地应用于流式分析和分选出目的细菌,可以在感染血液、痰液等样品中快速检测和识别感染的种水平的微生物。与常规实验室方法PCR、测序、培养等技术。流式-FISH结合的方法,快速检测特定的细菌,初步试验还表明可以对细菌进行分选,检测常见感染10多种微生物,如肺炎克雷伯氏菌属肺炎克雷伯菌,链球菌、金黄色葡萄球菌,致病大肠杆菌等等,甚至还有一些真菌和部分寄生虫。
流式细胞技术应用于原位杂交,对标本处理要求不同,不需要用福尔马林固定,对标本是当处理,适合用于快速鉴别在各种肺部感染、败血症患者、肠道感染微生物检测,能达到属或种的水平检测。
流式细胞检测细菌实验步骤
(1) 血清、污水、呕吐物、牛奶等液体,适当的溶液处理,8000rpm,离心1分钟;
(2) 吸取上清20μL,加入配置好的核酸探针,85℃加热样品5分钟,60℃孵育30分钟;
(3) 流式细胞仪上机检测,流式务必做好对照。包括只含空白探针对照、单纯待检测样品对照、待检测样品对照。
(4) 结果分析,设门的时候需要,颗粒大小参考对照,荧光变化参考对照。
如果遇到更多问题,请联系我们。我们提供探针、试剂盒、耗材、设备等等。
联系电话:020-89895006 180 1199 7127 (24小时) E mail:focobio@126.com
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